Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms