Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
VhlP40338 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VhlP40338 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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