Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab18P35293 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab18P35293 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms