Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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