Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Saa4P31532 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms