Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd28P31041 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms