Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms