Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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