Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb2P27090 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms