Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd8P23463 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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