Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tap1P21958 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tap1P21958 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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