Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou3f1P21952 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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