Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a2P20490 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a2P20490 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms