Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18529 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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P18529 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18529 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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