Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18528 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18528 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18528 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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