Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Hoxb1P17919 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Hoxb1P17919 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Hoxb1P17919 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb1P17919 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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