Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms