Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DmdP11531 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
DmdP11531 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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DmdP11531 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
DmdP11531 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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