Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl2P10148 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl2P10148 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms