Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LtaP09225 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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