Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms