Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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