Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P04212 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P04212 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P04212 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms