Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-Ab1P01921 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Ab1P01921 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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