Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms