Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ldb2O55203 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ldb2O55203 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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