Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsksO54887 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TsksO54887 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms