Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DffaO54786 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DffaO54786 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DffaO54786 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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