Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Slc18a3O35304 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms