Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Flot1O08917 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Flot1O08917 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Flot1O08917 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Flot1O08917 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Flot1O08917 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Flot1O08917 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Flot1O08917 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms