Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Eftud2O08810 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Eftud2O08810 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms