Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3278L7N2D2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms