Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms