Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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