Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20795J3QP49 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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