Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm20834J3QM72 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms