Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem200cJ3QK46 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem200cJ3QK46 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem200cJ3QK46 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmem200cJ3QK46 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem200cJ3QK46 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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