Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm20830J3KML6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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