Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r34G3XA52 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r34G3XA52 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms