Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms