Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r167G3UW71 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r167G3UW71 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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