Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm16519F8VQK7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms