Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptbn5F6UCX4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms