Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms