Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rd3lB2RV38 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rd3lB2RV38 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms