Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt4B2RU40 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms