Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M5A7VMS3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M5A7VMS3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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