Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm6880A3KG45 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6880A3KG45 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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