Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2al1jA2BFR3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms