Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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